Çağdaş bir durumdaki müzecilik faaliyetlerinin yürütülmesi için olanak tanıyan fiziki şartların sağlanmış olduğu Mersin Arkeoloji Müzesi içerisinde eserlerin sergilenecek olduğu salonların yanında geçici bir şekilde kurulan sergi salonları, çocuklara özel olarak yapılan arkeopark uygulama alanları ile birlikte kütüphane, hediyelik eşyalar için satış yeri, kafeterya benzerindeki sosyal bazı alanlar da yer alıyor.
Müze içerisinde toplam olarak 1435 tane eser sergileniyor. Ziyaretçiler, giriş kat kısmında yere alan zaman tüneli içerisinde tarihe bir yolculuk yapmanın yanı sıra kronolojik sergi salonu içerisinde uygarlıkların her bir alanda nasıl gelişmiş olduğu ve neler yapabilmekte olduklarını izleme, ölü kültü alanlarında çok daha değişik kültürlerde ölü gömme geleneklerini öğrenebilme, etnografik salon içerisinde insanların geçmiş dönemlerden günümüze kadar kullanmış olduğu etnografik eserlerin yanı sıra Yumuktepe Höyüğü’ne yakın bölgede bulunmuş olan Huğ Evi’nin replikasını görme konusunda bir fırsat elde etmektedir.
Birinci kat kısmında sergilenmekte olan sikkelerle aynı salon içerisinde 9.000 seneden beri kesintisiz bir şekilde yerleşim görmekte olan Yumuktepe Höyüğü’nün canlandırmasının yanı sıra kazıdan çıkmış olan eserleri uygarlıklar hakkında bilgi veriyor.
Buraya ziyaret gerçekleştirenler, Mezitli İlçesi içerisinde yer alan Milattan Önce 3’üncü bin seneden Milattan Sonra 6’ncı yüzyıl döneminin sonlarına dek iskân görmüş bulunan Soli-Pompeipolis Antik Kenti ve de Erdemli İlçesi içerisinde yer alan Milattan Önce 4’ncü yüzyıl dönemlerinden günümüze dek yerleşim görmüş olan ve Antik Dönem’lerde zeytinyağı ticaretiyle ün kazanan Elaiussa-Sebaste Antik Kenti’nin arkeolojik bir durumdaki zenginliğine tanık olabilmektedir.