Anadolu Medeniyetleri Müzesi Ankara ilinde yer alan Ulus ilçesindeki Atpazarı şeklinde isimlendirilmiş olan semtte ve Ankara Kalesi’ne ait olan dış duvarının güneydoğu kıyı kısmında yeni bir işlev verilip düzenlenen iki tane önemli Osmanlı binasından meydana gelmektedir. Bu söz konusu yapılardan bir tanesi Mahmut Paşa Bedesteni olarak öne çıkarken ötekisi de Kurşunlu Han olarak bilinir.
Mahmut Paşa Bedesteni’nin Fatih dönemindeki baş vezirleri arasında yer alan Mahmut Paşa aracılığıyla 1464 ila 1471 senelerinin arasında yapılmış olduğu tahmin ediliyor. Kurşunlu Han’ın da yine Fatih dönemi baş vezirleri arasında yer alan Mehmet Paşa’nın İstanbul ilinin Üsküdar ilçesinde yer alan imaretine vakıf şeklinde yaptırılmış durumdadır. 1881 senesinde gerçekleşen yangının ardından terk edilmiş olan her iki tane yapı da daha sonrasında Atatürk’ün talepleriyle beraber Anadolu’dan toplanmış olan eserleri sergileme maksadıyla uzun seneler boyunca devam eden yenileme çalışmalarının ardından müzeye döndürülmüştür.
Bedestenin tam orta kısmında yer almakta olan kubbeli mekânın çok büyük bir bölümünün onarım işlemlerinin 1940 senesinde bitirilmiş olmasıyla beraber eserler de buraya yerleştirilmeye başlanmış, 1943 senesi içerisinde binaların onarımı halen sürerken de, orta bölüm ziyaretçiler için tamamen açılmıştır. Müzenin yapısı 1968 senesi içerisinde de son şeklini almış durumdadır. Bugün içerisinde idari bina şeklinde kullanılmaya devam edilen Kurşunlu Han’da araştırmacı odalarının yanı sıra konferans salonu ile birlikte kütüphane, laboratuvar ve bir de iş atölyeleri yer alıyor, Mahmut Paşa Bedesteni de burda teşhir salonu şeklinde kullanılıyor.